柠檬酸锅炉清洗结垢的化学机理：用柠檬酸进行清洗结垢锅炉，主要不是用它的酸性来溶解铁的氧化物，而是利用它和铁离子生成络离子的能力柠檬酸。
柠檬酸多用于新超 高压直流锅炉的结水系统(炉前系统)及过热器、再热器等的氧化铁皮和腐蚀产物的清洗柠檬酸。由于锅炉清洗是以络合溶解的方式进行，可以避免氧化铁鳞片脱落而堵塞管道等的情况发生，一般的柠檬酸清洗工序为：水洗——碱洗——酸洗——钝化。
柠檬酸作为清洗剂的优势是腐蚀性小、无、容易保存和运输、安全性好、清洗液不易形成沉渣或悬浮物,避免了管道的堵塞；使用柠檬酸进行锅炉清洗，清洗系统简单，不需对阀门采取防护措施，安全性好柠檬酸。